2009年，乔布斯再度入院接受治疗，库克再度代理乔布斯的职位。在乔布斯离开期间，库克管理苹果的日常运营，并受到好评。一些与苹果存在业务来往的人士说，在乔布斯2009年离开时，苹果的产品研发没有迟滞，定期发布。
在这期间，iPhone第三代成功发布、iPod Shuffle推出新一代、MacBook得到改良，苹果还进行了与中国联通的谈判。库克维持着苹果的运转。
在乔布斯请病假的六个月内，苹果在库克的领导下发展良好，股票价格上涨67%。 苹果董事会为表彰库克的突出表现，奖励他500万美元。
中国联通相关人士就对记者表示，库克身上并无光环，但表现出的职业素质令人称道。
Gartner分析师米拉内西表示，无论是在苹果的内部还是外部，库克都受到尊重。他已经证明能够很好地运营苹果。
不过，目前很难预测苹果的长期表现。在没有乔布斯创造性天才的情况下，库克是否有能力推出另一款新产品？自1997年回归苹果以来，乔布斯已经将苹果变成全球市值第一大的科技公司。苹果推出的多款产品均获得消费者的追捧。
虽然具备很强的运营能力，但库克作为一个领导的个人魅力、影响力以及市场洞察和创新能力远不及乔布斯。苹果的根本是乔布斯所做出的产品设计和营销。而库克并未在这一领域有所表现。
乔布斯依然是苹果的精神领袖。但，或许外界需要开始慢慢习惯一个没有乔布斯的苹果。
库克：不会效仿乔布斯 做苹果的“救火队员”
据国外媒体报道，《纽约时报》网站日前刊登文章称，苹果首席执行官史蒂夫·乔布斯（Steven P. Jobs）病休之后，公司首席运营官蒂姆·库克（Timothy D. Cook）再次充当“救火队员”。库克与乔布斯具有截然不同的性格，在工作中的专注领域也不尽相同。作为苹果的新舵手，库克不会效仿乔布斯的管理方式，他在IBM、康柏，以及苹果重新崛起的 过程中已经证明了自己的能力。尽管库克不可能成为像乔布斯那样的“幻想家”，但分析师和前苹果员工均看好由库克掌舵的苹果未来。
以下为《纽约时报》文章：
几年前，在从加利福尼亚到新加坡的18个小时飞行过程中，苹果首席运营官蒂姆·库克几乎没有时间与坐在旁边的同事聊天。端坐在经济舱里的库克一直在研究表格，为全面评估苹果的亚洲业务做准备。
库 克和同事早上6点抵达新加坡，简单洗澡之后就与苹果当地高管召开会议。12个小时之后，晚宴时间早已错过，当地高管结束了会议。陪同库克的苹果高管迈克 尔·詹尼斯（Michael Janes）表示：“他们非常疲惫，然而蒂姆却一点都看不出来。他完全有精力跳到下一组幻灯片汇报。他毫不松懈。”
这种毫不松懈的精神将在接下来几个月里发挥至关重要的作用，因为库克接受的挑战史无前例。由于苹果首席执行官史蒂夫·乔布斯因病休假，库克将负责苹果的日常运营管理工作。
过去库克曾两次充当苹果的“救火队员”，两次经历都简短而成功。然而如果乔布斯的健康状况没有改善，库克将长期担负这一职责。尽管苹果掌门人的继承计划严格保密，但库克仍被广泛看作是最有可能接替乔布斯的人选。
与乔布斯互补
在 硅谷，乔布斯同样以坚持不懈闻名。然而在很多方面，乔布斯与库克截然相反。乔布斯非常善辩而且感情易于爆发，而库克则更加温和和彬彬有礼。成长于亚拉巴马 州一个小镇的库克经常被称为是“南方绅士”。乔布斯专注于苹果产品的每一个细节，而库克则专注于苹果运营过程中不太引人关注的琐碎工作。
