SDN表现出很多优点，但同时也面临着诸多难题：如安全问题、复杂度问题以及实时性问题。由于控制器存在着单点失效问题，网络的安全性较差，一旦控制器被攻击，网络将瘫痪。同时，路径计算完全依靠中心控制器，控制器的计算量极大，同时，控制器需实时监测每一条进入网络的流且需实时为其分配一条路径，实时性能否保证还不得而知。如果在公网上部署SDN网络，就很可能会导致网络被少数实体（如运营商）所控制，因为只要控制了SDN控制器，那么每一个流的转发行为会被完全控制，很可能会造成网络资源的分配不公，如给某些用户或业务给予更高的优先级，同时打击某些用户或业务，从而导致网络资源被人为干预的程度大大加强。
从SDN的性质可以看出这种新技术比较适合于企业网，尤其是数据中心。因为企业网的规模不是很大，SDN控制器的压力较小，更重要的是，企业网是由一家企业所运营，SDN控制器的选路策略仅由一家企业决定，不易引起利益冲突。假如将SDN网络部署到公网，那么SDN控制器的转发策略所涉及的将不仅仅是技术问题，更多的是商业问题，因为在SDN网络中，数据流的路径是可控的，显然，每个商业实体都希望自己的数据流能从链路状况较好的链路通过，易引发利益之争。总的来说，SDN网络虽然风头很盛，但其仍处于发展的早期阶段，还有很多问题没有解决。对于新事物，一方面我们要看到其发展潜力，另一方面也要看清其存在的不足，然后针对其不足开展工作，最后做到为我所用。(CNNIC 邓光青)
