不过，随着苹果去富士康化的进行，富士康的产业链优势也受到挑战。

从2012年开始，苹果尝试寻求代工厂的多元化，加速去富士康化。2012年，苹果将iPad Mini和iPhone 5C订单转给了台湾另一家代工企业——和硕联合，由和硕生产的iPad Mini从2012年第四季度开始大量出货。2013年12月，苹果又新增纬创集团和华宝通信为代工厂商。

事实上，随着代工利润的下跌，富士康这两年的业绩表现并不好。2012年，富士康国际控股出现大面积亏损，净亏损高达3亿多美元。

据《证券日报》记者观察，富士康在2013年已经开始改变过去和一线国际大厂合作的惯例，大陆的小米和乐视以及一些新锐科技品牌也成为了富士康的座上宾。另外，富士康也在加强对终端渠道和产品的渗透。

但随着高管集体索贿事件的案发，有观察人士指出，富士康的管理困境再度让人忧虑。内在管理和外在市场的双重压力将困扰富士康。