2010年5月，王小川去杭州游说马云，希望能够引入阿里巴巴的战略入股。搜狗给以阿里集团的价值在于，在搜索布局里，能够抵挡360吞并搜狗，防止更大的巨头起来，如果搜狗能够起来也能制衡百度。而另一方面，搜狗输入法与浏览器也能够给阿里带来不小的流量支持，譬如输入法与购物关键词的合作。
王小川最终说服马云，与阿里的合作对于张朝阳来说，也是极具吸引力的—无论是与周鸿祎，抑或是马云合作，他都希望搜狗能够带来更多的收益。更何况，电商是重要的互联网广告客户，与阿里的合作意味着更加确立的广告收入。
2010年8月9日，搜狐与阿里巴巴正式签约，共同成立新的合资子公司—搜狗，其中阿里巴巴和云峰基金二者共占股16%，张朝阳个人占股16%，搜狐集团保留剩余68%股份。搜狗独立后，王小川担任CEO，隐忍数载后，王小川最终开始通过“输入法+浏览器+搜索”的三级火箭模式再次回到搜索引擎主战场。
入股搜狗之后，阿里集团总参谋长曾鸣加入搜狗董事会。不过，也正是这一年淘宝推出了自己的购物搜索引擎一淘网。从动机抑或是双方的战略来看，这注定了是场短暂的婚姻。
搜狗独立后，张朝阳有了更多的精力关注起微博大战，一个月后，沉默几年的张朝阳重新回到镁光灯下，提出“再造搜狐”，视频、搜索、微博和游戏将是搜狐站点发展的四大方向。
耐力赛
2012年7月2日，王小川通过内部邮件表示，搜狗回购阿里巴巴所持有的10%的股份。王小川解释，随着战略升级，搜狗预期阿里集团难以继续在战略层面继续加强相关支持。
一位搜狗员工称，2011年10月搜狗首次超过谷歌成为第二大中文搜索引擎，那时候就曾提出回购的计划。2011年是阿里集团本命之年，也是多事之秋，一方面由于精力所限无暇顾及，另一方面也是“价钱没谈拢”。“作为购物搜索引擎的一淘在淘宝分拆之际获得独立身份，阿里与搜狗所设想的合作模式并未如计划般进行。”他表示，“最重要的是，作为战略投资者，扶植搜狗制衡奇虎360的计划已经实现，市场动态平衡目的也完成，更何况，1500万美元投资拿到2580万美元，也算是不错的财务回报。”
必须承认，虽然无论是搜索抑或是客户端流量导入，搜狗分别与百度、奇虎360都有差距，但这并不妨碍这家公司已经具备独立成长能力。独立之后搜狗赶上了一段好时光——2010年3Q大战前后，奇虎360无暇顾及搜狗的竞争，并且恰在电商市场快速增长期。
搜狗、阿里婚变的同时，王小川也为搜狗制定了“进攻百度，防范360”的竞争策略。王小川说，“百度业务构架的软肋在于对入口控制能力不够强。用户上网启动搜索前，必须打开浏览器，必须用输入法，这些都不在百度手里”。
入口控制能力的不足，也导致了百度市场份额的逐渐蚕食。王小川透露，百度有一半的流量不是百度首页(baidu.com)带来的，而是hao123或者其他导航网站、浏览器地址带来。于此同时，谷歌80%的流量不是来自谷歌首页，今年一季度谷歌市场占有率低于搜狗8.9%，其中有近一半的流量由奇虎360提供。
“百度市场份额被逐渐蚕食的一个信号就是，去年360导航页流量超过hao123。”王小川说，“倘若奇虎360与搜狗合作，我觉得拿下20%至25%的份额不是一件难?事。”
王小川透露，“进攻百度”分为两部分，“以正合，以奇胜”。所谓“正合”就是进一步加大客户端产品的研发与升级，加大这一领域的优势，譬如，今年下半年将推出搜狗壁纸。“奇”指的是，“非百度搜索”。
“非百度方式搜索引擎”是搜狗自有的“推荐引擎”。王小川解释说，“用户获取信息将有两种方式，一种是明确知道自己需求，通过输入关键词获得。而另一种则是用户浏览网页时，我们通过数据挖据与计算‘猜’出他要什么，并推荐给他们”。譬如，用户在看“天空下载”，搜狗会推荐他们更新版本的软件或官网版本，用户在看视频时，向他们推荐更高清版本、更快速的，或者下一集在什么地方。要做推荐引擎一方面是个性化问题，而另一方面则是计算的问题。
