首批苹果Ⅲ几乎全部被召回过，苹果公司不得不免费更换多达14000台苹果Ⅲ电脑，乔布斯后来在接受采访时表示：“损失很大，算不过来。”苹果Ⅲ失败的责任有很大一部份应该归结到乔布斯的头上，可是在这一切问题暴露时，乔布斯早已脱身，离开这个项目，进入到丽萨项目组。
有媒体称，丽萨项目的名称来源于乔布斯私生女的名字，乔布斯起初不认这个私生女，但后来又认了，给她起的名字就是“丽萨”。乔布斯在丽萨项目组中常说：“我们做出来的东西意义将极其重大，肯定会在大学校园里引起轰动。”
当时，丽萨项目在苹果被视为明日之星，项目组成员自己也觉得高人一等，进入他们的工作区要带着一枚独特的黄色的徽章。别的项目组成员评价丽萨项目的工程师“个个觉得自己是电影里的头号女主角”。
乔布斯想把控丽萨项目。然而斯科特认为，苹果Ⅲ项目的失败验证了乔布斯不是一位好的技术项目管理人，斯科特可不想让乔布斯又毁了公司这个至关重要的项目，这可不是个人恩怨。
斯科特采取突然袭击的方式，通知乔布斯离开丽萨项目组。乔布斯回忆：“在确定了概念框架，找到了关键人选，并且确定了技术方向后，斯科特认为我没有运营这一业务的经验。这对我打击很大，这一点显而易见。”
为了安抚乔布斯，马库拉出面协调，让乔布斯做有名无实的董事长。斯科特也安慰乔布斯，说苹果公司正准备计划公开发行股票，这件事非常需要他。他们两人恭维乔布斯外貌英俊，是媒体争相报道的“红人儿”。他们还说，如果让乔布斯这位25岁的年轻帅哥当上一家资产上亿美元公司的董事长，会带来轰动的公众效应，刺激公司新股上市价格。接着，为了让闲不下来的乔布斯有事干，斯科特还同意他去掌管麦金塔(Macintosh)这个当时对苹果来说无足轻重的项目。
从当时苹果发展前途来考虑，斯科特和马库拉的安排不无道理。早年的乔布斯给苹果许多员工的印象并不好，苹果早期的软件开发专家布鲁斯·托格那齐尼曾说，他们在苹果公司并不是为乔布斯打工，而是为马库拉或者斯科特工作。
有过河拆桥嫌疑的免职
1981年2月25日，在征求过乔布斯和马库拉的意见后，认为苹果公司人浮于事的斯科特决定裁员。
从9点钟左右开始，他把一些员工挨个叫进他的办公室，告诉他们卷铺盖走人。没人知道原因，也没人知道下一个轮到谁。
斯科特中午开会时说：“我曾经说过，当担任苹果公司CEO不再是一件有趣的事的时候，我会退出苹果公司。但今天我改变了主意，当它不再有趣的时候，我会解雇员工，直到它再次成为有趣的事。”
以今天的眼光来看，斯科特的这次裁员是小儿科，1500多员工中仅裁掉40人左右，但在当时蓬勃发展的苹果公司，工程师们认为这是一个不可接受的“残暴”之举。有人说：“你请来一个工程师，如果他每件事都做错，那就让他当经理吧！这里从不解聘人！”这是个笑话吗？不，笑话是当时的许多苹果员工认为这不是笑话。
苹果员工对解聘怨声载道，对高管层纷纷表示不满。乔布斯表示此举与自己无关，暗示一切都是斯科特所为，于是矛头都指向斯科特。
此时的苹果公司是“夕云初起日沉阁，山雨欲来风满楼”。看到局面有些不可收拾了，马库拉出面召开董事会，决定罢免斯科特，乔布斯对此表示赞同。他们的理由是斯科特裁员之举没有走公司程序流程，不符合苹果的文化，损害了公司的整体利益。
而沃兹则坚定地认为，斯科特解雇了应该解雇的人。虽然，斯科特曾训斥过他，但他表示，“我很喜欢斯科特这个人，喜欢他思考问题的方式，也喜欢他一张一弛的风格。”
曾任《时代》周刊记者的Michael Moritz在《The Little Kingdom》中写到：“苹果公司内部有人认为，他(斯科特)是幕后交易和血腥阴谋的牺牲品。”
